出现的PCR扩增条带与目的靶序列条带一致,有时其条带较整齐,亮度较高。
引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。
靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个基因组或大片段的交叉污染,导致假阳性。这种假阳性可用以下方法解决:操作时应小心轻柔,高GC高保真酶,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外。除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管及样进枪头等均应一次性使用。必要时,在加标本前,反应管和试剂用紫外线照射,以破坏存在的核酸。二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,与引物互补后,可扩增出PCR产物,而导致假阳性的产生,可用巢式PCR方法来减轻或消除。
基因分型
PCR可用于检测特定细胞或生物体中等位基因的序列差异。例如,基因敲除和敲入小鼠等转基因生物的基因分型[3]。引物对经设计位于目标区域侧翼,可根据是否存在扩增子及扩增子长度来检测遗传变异。
但是如果为了检测特定核苷酸突变,则必须对扩增的序列进行进一步分析。例如, PCR扩增子测序就是研究单核苷酸变异(SNVs)和单核苷酸多态性(SNP)的方法之一。强烈推荐使用高保真DNA聚合酶,以防止在PCR过程中引入多余的突变。
通过PCR进行基因分型也是对癌1症和遗传病中的 突变进行遗传分析的一个基本方式。
PCR反应特点
灵敏度高:PCR产物的生成量是以指数方式增加的,能将皮克(pg=10-12)量级的起始待测模板扩增到微克(μg=-6)水平。能从100万个细胞中检出一个靶1细胞;在病毒的检测中,PCR的灵敏度可达3个RFU(空斑形成单位);在细菌学中zui小检出率为3个细菌。
简便、快速:PCR反应用耐高温的Taq DNA聚合酶,一次性地将反应液加好后,即在DNA扩增液和水浴锅上进行变性-退火-延伸反应,一般在2~4 小时完成扩增反应。扩增产物一般用电泳分析,不一定要用同位素,无放1射性污染、易推广。
纯度要求低:不需要分离病毒或细菌及培养细胞,DNA 粗制品及RNA均可作为扩增模板。可直接用临床标本如血液、体腔液、洗嗽液、毛发、细胞、活组织等DNA扩增检测。
高GC高保真酶-武汉友名生物公司由武汉友名生物技术有限公司提供。武汉友名生物技术有限公司是湖北 武汉 ,其它的见证者,多年来,公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针,满足客户需求。在友名生物**携全体员工热情欢迎各界人士垂询洽谈,共创友名生物较加美好的未来。
武汉友名生物(U-MeBiotech)技术有限公司成立于2009年5月18日。公司致力于为广大科研工作者提供品质的生命科学产品和专业、有效的技术服务。公司对所有岗位员工都经过了严格的培训,对所销售的产品及其使用都比较熟悉。同时,在公司内部定期开展自我提高学习培训,由各岗位员工对所销售的产品进行系统培训学习,并进行严格的考核。这都为公司的专业化服务提供了有力**!公司目前主要从事分子生物学,蛋白质研究、细胞学研究,NGS等相关产品的销售及技术服务,同时也开展生物化学原料的合成,实验技术服务。